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Bactériologie : Métabolisme et nutrition

Types trophiques : Classification nutritionnelle des bactéries

Dans cette vidéo, nous classons les bactéries selon leur source d’énergie, de carbone et d’électrons, puis selon leur relation à l’oxygène.

Toutes les bactéries ne se nourrissent pas de la même façon. Certaines captent la lumière, d’autres oxydent des minéraux ou dégradent la matière organique. Cette vidéo présente la classification nutritionnelle des bactéries et leur relation à l’oxygène, deux notions essentielles pour comprendre leur culture au laboratoire.

Les trois critères de classification

Pour se développer, une bactérie a besoin d’une source d’énergie, d’une source de carbone pour construire ses molécules et d’un donneur d’électrons pour ses réactions d’oxydoréduction. Le type trophique d’une bactérie est défini par la combinaison de ces trois critères.

Source d’énergie : phototrophes et chimiotrophes

Les bactéries phototrophes utilisent l’énergie lumineuse grâce à des pigments photosynthétiques. Les bactéries chimiotrophes tirent leur énergie de l’oxydation de composés chimiques, minéraux ou organiques. La grande majorité des bactéries d’intérêt médical sont chimiotrophes.

Source de carbone : autotrophes et hétérotrophes

Les bactéries autotrophes utilisent le CO₂ comme unique source de carbone et synthétisent elles-mêmes leurs molécules organiques. Les bactéries hétérotrophes ont besoin de composés organiques préformés (sucres, acides aminés…) qu’elles prélèvent dans leur environnement.

Donneur d’électrons : lithotrophes et organotrophes

Les bactéries lithotrophes utilisent des donneurs d’électrons minéraux comme H₂, NH₄⁺, H₂S ou Fe²⁺. Les bactéries organotrophes utilisent des composés organiques. En combinant les trois critères, on obtient des types comme les photolithoautotrophes (cyanobactéries), les chimiolithoautotrophes (bactéries nitrifiantes comme Nitrosomonas) ou les chimioorganohétérotrophes, groupe qui inclut E. coli et la plupart des bactéries pathogènes.

Relation à l’oxygène

Les bactéries aérobies strictes ont besoin d’O₂ pour respirer (Pseudomonas aeruginosa, Mycobacterium tuberculosis). Les anaérobies strictes sont tuées par l’O₂ car elles ne possèdent pas les enzymes de détoxification de ses dérivés toxiques, la catalase et la superoxyde dismutase (Clostridium). Les aéro-anaérobies facultatives se développent avec ou sans oxygène (E. coli, Staphylococcus). Les microaérophiles exigent une faible concentration d’O₂ (Helicobacter pylori, Campylobacter). Les anaérobies aérotolérantes ne l’utilisent pas mais le supportent (Streptococcus, lactobacilles).

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